事实上，这也是马英九近两个月来第二度就此进行表态。8月27日，马英九在接受“中央社”专访时曾表示，两岸互设办事处的想法“早在20年前就有了”，上世纪90年代初海基会成立之初就表示将来还会在大陆设立办事处，结果却因为有人追问“是不是像领事馆”而无果。两岸现在都有意愿互设办事处，希望能尽快促成，这个办事处应具综合功能，这对在大陆的台湾民众帮助非常大，对来台的大陆民众也有帮助。

对于马英九的上述表态，台“陆委会”随即也证实，两岸互设办事处原来就已经列入台当局“黄金十年”大陆政策之中，“陆委会”已经就此与相关部门进行了研议。11日，台“陆委会”主委王郁琦表示，两岸互设办事处事实上分为两阶段，第一阶段是海基会、海协会互设办事处，目前已经在研拟中；至于超越两会互设办事机构，“陆委会”将全力以赴尽快研究。

据台湾《经济日报》11日报道，国台办副主任叶克冬10日表示，两岸经贸办事处虽迟未设立，但双方都有共识，希望大家“静待佳音”。国台办发言人杨毅10日也说，大陆注意到马英九谈话有关两岸关系的内容，希望两岸双方继续在坚持“九二共识”、反对“台独”的共同基础上，加强交流合作，解决实际问题，增进同胞福祉。

国民党籍“立委”丁守中认为，未来设办事处后，台商在大陆遇到问题可直接找办事处寻求协助。台湾政治大学教授赵建民表示，现在每年有500万台湾民众到大陆旅游做生意，在大陆长期居住的台商有近100万，两岸互设办事处不但对在大陆的台湾人有立即性照顾，突发事件也能立刻联系，象征两岸关系更进一步。

但前民进党主席蔡英文质疑称，马英九过去处理两岸问题从来不进行沟通，这次要设办事处用意在哪儿、目标在哪儿？这是很复杂的两岸问题，马“不能轻忽，也不能当作文宣处理”。民进党“立委”陈其迈、民进党籍前“陆委会”副主委黄伟峰等人认为，两岸应争取设立有“外交”、“领事服务”功能的代表处，但是大陆定位“两岸同属一个国家”，短期内不可能给予台湾驻大陆机构“大使馆级待遇”，若马英九急于在第二任期内推动，该机构恐沦为“各省驻京办”，充其量只是大陆对台“统战机构”，届时台湾“主权”不但被矮化，两岸定位还会因此被制度化、明确化。（驻台北特约记者张华 特约记者李名山）