4月12日,由苏州吉浦迅科技主办,英伟达(nvidia)和华硕电脑协办,联合中国科学院、西安交大、上海交大等多家高等院校和科研院所共同举办的“gpu超级计算机生物分子模拟应用”系列研讨会正式启动;当日在中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所成功举办了首场研讨会,吸引了众多业内人士的关注,并引发了业界对如何将gpu并行加速技术与生化信息技术结合,以更为有效的成本实现生物技术的新突破等问题的关注和探讨。
当前,生物科学的快速发展所带来的变革被视为人类的第四次产业革命,也被看做是解决当前人类发展瓶颈的主要途径。与前三次工业革命相比,生物科学的发展更多依靠大规模的科学计算和系统的科学实践逐步成长起来,而随着研究内容的逐步深入,无论是在数据规模或计算效率方面,生物科学研究都对计算平台有了更为严苛的要求。因此,采用具有超级数据处理能力的计算工具保障生物科学研究工作的高效进行,已成为生物科学研究领域的共识。
传统高性能计算多用于军事科学、航空航天、石油勘探等领域,普遍采用多cpu计算方式实现高密度数据计算,其计算平台特点是体积庞大,搭建和使用成本高昂,这些不足使得cpu架构的超级计算机难以在一般的科研机构以及公司中大规模使用。英伟达(nvidia)公司生物领域技术经理allen表示,“专门为大规模计算而设计的cpu+gpu并行超级计算机不仅具备的卓越浮点性能,显著提升众多科学应用程序的计算性能,同时还在搭建成本、能耗控制等多个方面具有明显优势,因此受到了越来越多的用户的认可,逐渐成为超算的主流。”
本次会议上,华硕电脑展示了从桌面级到集群级esc系列gpu超算计算机,凭借单机近2000个gpu计算核心和单机最高每秒超过4万亿次的强大计算性能,华硕esc超级计算机顺利完成amber,namd,vmd,cmach,matlab/jacket等多款分子模拟软件的复杂计算演示,得到了在场专家的一致认可。
据介绍,华硕esc超算系列计算机是华硕为科学计算客户定制的超级计算机产品,通过采用cpu+gpu协同计算架构,提供单台每秒上万亿次计算能力,为生命科学、医学、工程、金融建模、电子自动化等行业的专业人士提供了一个高性能、高稳定性的超算工作平台。目前华硕esc超级计算机家族已有esc1000、esc2000及esc4000三款产品推出,适合不同需求用户应用。
其中,esc1000、esc2000为桌面级超级计算机,主要面向于科研工作者,实现个人超算机的梦想。esc1000是世界上首个提供4块tesla并行计算卡解决方案的超算桌面平台,具有高达超过1500个计算核心,单机最高可实现每秒超过4万亿次的强大计算性能,为数据密集型计算带来了全新的解决方案。目前,该产品已成功应用于多个科研领域,成为了科研工作者的得力帮手。
此外,华硕最新推出的机架式esc4000也是本次研讨会现场的一大亮点,该型号定位于gpu集群计算领域。继2010年初成功推出桌面超级计算机esc1000,成功切入高性能计算领域,并奠定华硕在gpu超级计算领域的领导厂商地位之后。esc4000的面世充分显示出了华硕在超级计算领域的强劲实力,作为一款2u机架式高性能计算机,华硕esc4000充分展示出了具有前瞻性和创新性的设计理念,代表着超级计算机最新的应用趋势。据华硕服务器产品经理仓荣民介绍,“esc4000将于近期全面引入中国大陆市场,届时会给科学计算领域带来涵盖桌面级到集群级完整的解决方案,相信华硕gpu计算的整体解决方案会对整个科研领域产生积极而深远的影响”。
对于华硕电脑所带来的完整的esc系列产品解决方案,吉浦迅首席执行官陈泳翰给予高度评价:“华硕esc系列产品再一次展示了华硕电脑在设计研发上的绝对优势,同时华硕电脑对gpu计算的业务解决方案及客户应用上也有非常深的认识,作为华硕在国内的esc系列产品的战略合作伙伴及英伟达tpp认证供应商,吉浦迅将会协同华硕电脑及英伟达共同服务好国内客户,提供出更有行业针对性的解决方案,帮忙客户在有限的成本预算下改善计算效能,实现共赢。”
苏州吉浦迅科技有限公司作为国内首家定位于gpu应用的高科技企业,专注于gpu 整体解决方案的集成、规划、咨询,同时还涉足gpu应用系统外包及培训业务。据悉,除苏州外,“gpu超计算机生物分子模拟应用”系列研讨会还将在上海、天津、武汉、广州四地先后举办,与当地科研机构和行业用户共同探讨异型架构并行超算在生物科学领域的应用,助力我国生物科学研究事业的发展。
(本文来源:驱动之家mydrivers )